Между тем условия деятельности самой системы потребкооперации республики в военное время очень усложнялось. Во-первых большинство мужчин, работавших в системе потребкооперации, были мобилизованы на фронт. Так, председатель Тюлячинского РПС Гатауллин на совещании по итогам 1-го полугодия 1942 г. заявил:
"Почти все старые опытные работники мобилизованы в РККА"
В сельпо и райпотребсоюзы пришли новые кадры, в первую очередь женщины. И хотя штаты были полностью укомплектованы, для приобретения необходимого опыта требовалось время. Кроме того, условия военного времени, массовая эвакуация, загрузка транспорта военными перевозками на рушили межреспубликанские и межобластные торговые связи не говоря уже о том, что временно были потеряны целые регионы. Вскоре после начала войны была вновь введена карточная система снабжения продуктовыми и промышленными товарами.
Наконец, условия военного времени не могли не сказаться на продуктивности колхозного производства в самой республике. Резко сократились возможности заготовок сельхозпродуктов, а в результате перевода значительной части промышленности на выпуск военной продукции сократились и фонды на промышленные товары народного потребления. Тем не менее потребительская кооперация республики напряженно и продуктивно работала, изыскивая любые возможности для решения стоящих перед нею задач.